如果最大限度地降低运营成本是最重要的，并且处理器可以长期投资系统和设施，那么水冷式恒温冷水机组系统可能是最佳选择。由循环冷却塔系统提供的冷凝器冷却比在空气冷却冷凝器上使用的电驱动风扇便宜。实际上，塔式水冷却实际上可以用来代替寒冷天气中的冷水机冷却，或者如果不需要低于85°F（29°C）的工艺用水温度。
然而，水冷却涉及较高的初始投资，因为这些系统需要冷水机和循环塔系统，这又需要额外的泵，管道和罐。此外，由于蒸发，吹扫和渗出，所有水冷系统都会消耗大量的水。因此，如果关注水的成本，质量和保护，风冷式冷水机可能是更好的选择。
与水冷系统相比，风冷式冷水机组每吨的成本要低得多，这主要是因为它们需要更少的部件来建造和运行，并且需要更少的支持设备和管道。风冷式冷水机组的安装比水冷式冷水机组更快更容易。安装风冷式冷水机需要三件事：冷水机组位置，电气服务，工艺水泵和管道连接。
虽然中央风冷式冷水机组通常位于室外，但大多数便携式风冷式冷水机组都位于室内，在那里它们将热气流直接从冷凝器风扇送到工厂地板。这可能是不希望的，除了在凉爽的天气中，由冷凝器风扇产生的暖气流可以补充工厂的空间加热系统。在冷水机空间有限或环境温度高的情况下，风冷式冷凝器可位于室外，远离主冷水机，以节省空间或改善冷凝器性能。
